小便时尿分叉通常分为生理性原因（比如长时间憋尿、尿道口部分梗阻和性生活后等）和病理性原因（比如尿道结石、尿道炎和尿道肿瘤等）。针对不同的病因，治疗方法也不同。
1、生理性原因
1）长时间憋尿
大多数人夜间会减少排尿次数，膀胱内就会积存较多尿液而导致压力增加。排尿时由于尿液力量太大出现尿道口形态发生暂时改变而出现尿分叉。
2）尿道口部分梗阻
女性：阴道口正常会分泌分泌物，分泌物没有及时清理会堵塞尿道口周围而导致尿分叉。
男性：性生活后精液没有排干净而留在尿道，而且海绵体充血也没有完全消失，也会表现为尿分叉。这是正常生理现象，会自行消失。
2、病理性原因
引起小便时尿分叉的疾病有很多，包括尿道结石、尿道炎和尿道肿瘤等。
1）尿道结石
主要与年龄、遗传、饮食和环境等因素有关。尿道结石会堵塞尿道口，排尿就会受到影响而出现尿分叉。同时可能会出现排尿疼痛、尿排尿困难等临床表现。
2）尿道炎
通常是感染了各种病原体而引起了尿道炎症。患者的尿道粘膜在炎症刺激后会表现为渗出、水肿，进而造成尿道狭窄而出现尿分叉。同时可能会伴有尿痛、尿频等症状。
3）尿道肿瘤
病因尚不明确，通常认为与遗传、环境、饮食等因素有关。由于增生的肿瘤会导致尿道梗阻，进而出现排尿不畅、尿分叉等表现。同时可能会出现尿道灼热感、排尿疼痛等症状。